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Machine Learning unterstützt Pharmakogenetik
13.11.2023 Die Pharmakogenetik untersucht, wie die Gene eines Menschen die Art und Weise beeinflussen, wie er auf Arzneimittel reagiert. Wie Machine Learning dabei helfen kann, frühzeitig die passenden und wirksamen Medikamente für gewisse Gene zu bestimmen, zeigen Erin-Sophie Giezendanner und Minh Man Tran in ihrer Abschlussarbeit «Praxis der Pharmakogenetik aus Sicht der Statistik» auf.
Die beiden Medizininformatik-Absolvierenden haben im Auftrag des Pharmazentrums der Universität Basel die Analyse einer laufenden Beobachtungsstudie zu Pharmakogenetik mit dem Einsatz von Machine Learning vereinfacht. Das Studienteam der Uni Basel musste bis anhin sämtliche Daten der Studie manuell aus einer Excel-Datei auswerten. Das von den beiden Bachelors in Medizininformatik entwickelte Machine-Learning-Verfahren unterstützt das Studienteam gleich bei mehreren Arbeitsprozessen. Das Auftreten einer Medikationsänderung kann gut und schneller vorhergesagt werden. Zudem bietet das entwickelte Shiny Dashboard eine detaillierte Beschreibung der Studiendaten und ermöglicht Auswertungen mit kombinierten Daten, was die Suche nach ähnlichen Fällen anhand der Medikation und bestimmter genetischer Merkmale gestattet. Weiter konnten Erin-Sophie Giezendanner und Min Man Tran nachweisen, dass das Auftreten von Medikationsänderungen eng mit dem individuellen Arzneimittelmetabolismus zusammenhängt.
