Génétique animale

Nous étudions des marqueurs pangénomiques ainsi que des informations sur les lignées et les phénotypes afin d’optimiser les processus de sélection au sein des races agricoles d’animaux de rente. Ce faisant, nous tenons compte de la diversité génétique.

Compétences

  • Études d’association pangénomiques et signatures de sélection

  • Diversité génétique, consanguinité (ROH) et parenté
  • Monitoring des ressources génétiques animales
  • Estimation des composantes de la variance et estimation de valeurs d’élevage

Projets


En collaboration avec la Fédération suisse d’élevage ovin, nous estimons et développons la valeur d’élevage.

Pour la performance carnée, nous nous intéressons aux valeurs d’élevage du caractère «gain journalier jusqu’au 45e jour», en distinguant entre le potentiel génétique de croissance de l’agneau et le potentiel génétique de production laitière de la mère.  Sur cette base, nous cherchons à sélectionner des animaux qui croissent rapidement tout en produisant beaucoup de lait. Pour la fertilité, nous estimons la valeur d’élevage des caractères suivants: âge au premier agnelage, intervalle entre agnelages, taille de portée 1 et taille de portée 2.

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L’estimation de la valeur d’élevage constitue un instrument essentiel pour l’amélioration génétique des populations équines suisses. Les premières initiatives pour introduire cette méthode remontent aux années 1990. Elle a été adoptée en 2004 par la Fédération d’élevage du cheval de sport CH, puis en 2006 par la Fédération suisse du franches-montagnes. La mise en œuvre a été assurée par le groupe de travail «Génétique équine», composé de Christian Hagger, Fritz Schmitz-Hsu, Markus Schneeberger, Stefan Rieder et Pierre-André Poncet.

L’estimation de la valeur d’élevage repose sur de vastes ensembles de données issues de la description linéaire et des tests de performance. La méthode du maximum de vraisemblance restreint (REML) a été utilisée pour estimer les composantes de la variance pour 24 caractères de la description linéaire, pour la toise (hauteur au garrot), et pour les notes d’extérieur relatives au type, à la conformation et aux allures.

Les facteurs environnementaux systématiques tels le sexe, l’âge, le lieu et le moment du relevé des caractères, constituent des éléments essentiels de l’analyse et sont pris en compte dans les calculs. Des différences spécifiques à la race sont apparues, notamment en matière d’héritabilité de la hauteur au garrot.

Épreuves de performance et estimation de la valeur d’élevage
Comme les objectifs d’élevage et les utilisations des deux races de chevaux ne sont pas les mêmes, des caractères différents ont été pris en compte dans l’estimation de la valeur d’élevage:

  • Cheval de sport CH: quatre caractères du test en terrain (pas, trot, galop, saut en liberté), trois caractères de la promotion (chevaux de 4, 5 et 6 ans) et 28 caractères de la description linéaire.
  • Franches-montagnes: douze caractères du test en terrain (attelage, équitation), la proportion de marques blanches et 28 caractères de la description linéaire.

Pour les chevaux de sport CH, les valeurs d’élevage estimées ont été regroupées en trois index: allures de base, saut et promotion. Chez le franches-montagnes, les valeurs d’élevage pour les marques blanches de la tête, des antérieurs et des postérieurs ont été regroupées en un index spécifique.

L’estimation de la valeur d’élevage réalisée à la HAFL est un élément central du développement durable de l’élevage du cheval de sport CH et du franches-montagnes. Elle fournit une base scientifiquement fondée pour la sélection et l’amélioration génétique à long terme des populations équines.

Pferd Zuchtwertschätzung

Nous nous intéressons au suivi et à la conservation des races locales, analysons leurs spécificités et mettons en évidence des possibilités de préservation.

Un exemple actuel est le projet «Promotion de l’élevage et maintien de la variabilité génétique et de la santé de la race bovine grise rhétique». En collaboration avec des partenaires issus de la recherche et de la pratique, nous poursuivons divers objectifs.

Nos principaux axes d’études dans ce projet:

  • Analyse génétique de l’ensemble du cheptel: l’analyse par génotypage SNP permet de dresser un tableau complet de la diversité génétique de la race. Ces résultats permettent d’identifier les animaux de grande valeur génétique et de tenir compte des liens de parenté lors de futurs choix sélectifs.
  • Analyse des caractères spécifiques de la race: le génotypage SNP permet d’étudier les mécanismes héréditaires de caractères majeurs tels que la taille, la couleur de la robe et les variantes de protéines du lait.

(Partenaires du projet: ProSpecieRara; association Rätisches Grauvieh Schweiz; Braunvieh Schweiz; Institut de génétique, Faculté Vetsuisse, Université de Berne; soutien financier de l’Office fédéral de l’agriculture)

Rhätisches Grauvieh

Le lait de certaines chèvres d’appenzell ne se conserve pas, car il prend un gout rance. Certains producteurs de lait envisagent donc de changer de race. Le projet doit présenter des solutions contre ce rancissement.

Équipe et contact

Souhaitez-vous collaborer avec nous ou discuter de nos activités de recherche dans le domaine de la génétique animale? N’hésitez pas à nous contacter!